Da un lato, grandi set di dati biologici consentono di esprimere forti potenzialità analitiche e di migliorare i risultati della ricerca biomedica, dall’altro sollevano problemi legati alla gestione dei campioni biologici, al controllo della qualità dei campioni e dei dati, alla conservazione e conservazione a lungo termine.

Il progetto mira a implementare un sistema di gestione delle informazioni di laboratorio genomico (GLIMS) in grado di omogeneizzare, formalizzare e integrare i processi del flusso di lavoro di laboratorio umido (gestione del campione) e secco (analisi dei dati), al fine di

• migliorare la produttività e la competitività dei centri di ricerca,
• migliorare i flussi di lavoro dei processi di laboratorio,
• gestire i dati forniti da Next Generation Sequencing e Whole Genome Genotyping.

Sono stati individuati tre obiettivi principali:

• formalizzazione del processo di workflow;
• Implementazione del supporto al flusso di lavoro ICT;
• valutazione e convalida.

I GLIMS includeranno le seguenti funzionalità:

• gestione di macroprogetti, progetti, macroclienti, clienti, campioni biologici, piatti, fiale, lotti, magazzini, materiali di consumo e coorti di studio;
• monitoraggio della gestione e del trattamento dei campioni biologici;
• supporto e monitoraggio del flusso di lavoro di laboratorio.

Il GLIMS migliorerà la gestione delle attività relative alla fornitura congiunta o singolare dei seguenti servizi:

• Estrazione del DNA;
• Genotipizzazione del DNA;
• Sequenziamento del DNA;
• espressione genica.

Le funzionalità incluse supporteranno sia la gestione amministrativa del progetto che la gestione operativa del progetto, con un focus specifico sulle attività legate ai flussi di lavoro del laboratorio umido (validazione di campioni biologici, tracciamento errori, gestione documentale, ecc.) E ai processi di laboratorio a secco (analisi statistica , aggregazione e modellazione dei dati, ecc.).

Il GLIMS consentirà infine di gestire l’intero ciclo di vita dei dati genomici dalla registrazione del campione biologico all’elaborazione del campione biologico e all’analisi dei dati.

Un gruppo di ricerca consolidato con un rinomato profilo accademico e industriale.

• algoWatt SpA (IT)
• IMS – Istituto di Management Sanitario S.r.l. (IT)

in collaborazione con:

• Fondazione Filarete (IT)
• UNIL – Université de Lausanne (CH)